Apesar de ter ocorrido integralmente nas páginas de Tomb Raider (edições #46 à #48), Gathering Storm é uma história crossover que permite o encontro de Lara Croft com Magdalena. Ela gira em torno da Rapture, um artefato que permitiria a seu portador viajar para outras dimensões, inclusive o inferno. É um amuleto arcano visto como uma versão sombria do Santo Graal.
Sara Pezzini pede para que Lara pesquise o que conseguir sobre o artefato, pois ele pode estar ligado a um crime recente sob sua jurisdição. Lara se dirige a um museu católico onde um velho se recusa a ajudar, mas aparenta saber sobre o mesmo. Após sair do museu, Carlos Delarch — um traficante de armas na lista dos mais procurados da Interpol há 20 anos —, acompanhado de duas assassinas, entram no prédio e assassinam o curador e os seguranças. De lá, roubam um antigo livro, escrito por um monge que supostamente teria visitado o inferno no século XV.
Quando a cúpula do Vaticano toma conhecimento do roubo, eles debatem dizendo que o livro deveria ter sido destruído há muito tempo, uma vez que não pode existir em terras santas. Eles enviam sua maior agente, a Magdalena, para impedir o perpetrador — que eles assumem ser Lara Croft.
No primeiro encontro, a Magdalena diz que sabe quem Lara é e o que ela quer. Apesar de ter ordens explícitas, ela usa a Lança do Destino para consultar o coração de Lara antes de falhar em sua missão. Não vendo mal algum em Lara Croft, além de um conflito interno para se manter no caminho correto, a Magdalena fica triste pois deve cumprir suas ordens e não sua vontade: ela acredita no que Lara diz.
Já no segundo encontro, Lara derrota Magdalena. Durante a batalha, Lara arremessa Madalena para a beirada da ponte, onde a jovem fica pendurada. Momentos antes de cair para seu fim, ela se encontra ainda mais confusa quando é resgatada por Lara. Ouvindo seu tutor sinalizando que está com Lara na mira, Magdalena retribui o favor e derruba o helicóptero. Agora incerta de seu próprio futuro, ela decide trabalhar com Lara. Por ter dado as costas à igreja, o Vaticano se prepara para caçar
as duas com um esquadrão de elite.
Passando mais tempo juntas, elas podem se conhecer melhor. "Magdalena" é o denominador de uma linhagem de mulheres descendentes do sangue real, mas o verdadeiro nome da jovem é Patience. Assim como as outras que assumiram o manto nos últimos 2000 anos, ela carrega a Lança do Destino e age como uma guerreira e protetora da igreja.
A lança detecta a localização de Delarch, prestes a encontrar a Rapture através de uma fenda dimensional. Elas são emboscadas pelo esquadrão de elite no telhado do prédio, mas Magdalena recebe uma ajuda involuntária dos encantamentos de Delarch, que despertam uma força sombria que tenta tomar controle dela. Quando isso acontece, ela instantaneamente reconhece que Delarch deve ser impedido a qualquer custo.
Elas encontram o vilão momentos antes de ele obter a Rapture, mas Magdalena arremessa sua lança de forma a atravessar tanto o livro quanto o torso do homem, que acaba sendo sugado para dentro da fenda dimensional que ele havia conjurado com os encantamentos sombrios.
Sem ideia do que o futuro reserva para elas, Lara e Patience partem como amigas, apesar de terem se conhecido como adversárias.